1986年，通榆县辖18个乡（其中蒙古族乡3个），5个镇，151个村，663个自然屯。

　　1990年11月29日，通榆县人民政府批准，全县新分出19个村。至此，全县有170个村。

　　1992年11月21日，吉林省人民政府批准，撤消通榆县新华、四井子、龙山乡，设立新华、四井子、双岗镇。

　　1993年11月23日，吉林省人民政府批准，通榆县瞻榆乡东关、西关、东胜、民胜4个村划归瞻榆镇。同年12月10日，吉林省人民政府批准，通榆县永青乡红旗村划归开通镇；撤消乌兰花乡，设立乌兰花镇。

　　1995年，通榆县人民政府批准，通榆县边昭乡合并2个村。

　　1999年，通榆县人民政府批准，通榆县十花道乡、七井子乡分出4个村。

　　2000年，通榆县辖9个镇，14个乡，172个村，690个自然屯。 

　　2006年，通榆县辖8个乡(2个蒙古族乡)、8个镇，172个村、692个自然屯。